Plateforme de Biochimie & Biophysique (B&B) de l’IPNP

Présentation

La plateforme de Biochimie et Biophysique (B&B) de l’Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris (IPNP) est dédiée à la purification et l’analyse des protéines (natives ou recombinantes), la caractérisation des interactions protéine-protéine et protéine-lipide, et la production d’acides nucléiques (vecteurs ADN, ARNm).

Activités

Expertises

Les protéines (solubles ou membranaires) sont produites dans divers organismes (bactéries, cellules de mammifères) et purifiées/fonctionnalisées par chromatographie liquide à haute performance. Les protéines purifiées sont caractérisées (taille, état d’oligomérisation, structure secondaire) par électrophorèse, diffusion dynamique de la lumière sous plusieurs angles, dichroïsme circulaire et spectrométrie de masse (réalisée en collaboration). Leurs interactions avec des lipides ou d’autres protéines sont mesurées par spectroscopie, ultracentrifugation préparative et adsorption sur monocouche.

Equipements

Biologie moléculaire
• 1 thermocycleur : Nexus X2 – Eppendorf
• 1 lecteur de gel d’ADN : E-Box – Vilber
• 2 spectrophotomètres : 1 D30 – Eppendorf et 1 BioDrop

Culture de procaryotes et eucaryotes
• 1 poste de sécurité microbiologique
• 3 étuves
• 4 incubateurs/agitateurs : 3 Multitron – Infors et 1 Innova 43 – Brunswick

Rupture de cellules
• 1 homogénéisateur : Emulsiflex-C3 – Avestin
• 2 sonicateurs : 1 sonicateur à pointe UP200ST – Hielscher et 1 sonicateur à bain Elmasonic S180H – Elma

Purification des protéines
• 1 système de chromatographie : ÄKTA pure 25M – GE Healthcare
• 1 lyophilisateur : Heto PowerDry LL1500 – Thermo Scientific
• 1 système d’eau pure et ultra-pure : Milli-Q Integral – Millipore

Analyse des protéines
• 1 système l’électrophorèse sur gel : Mini-PROTEAN Tetra Cell avec Trans-Blot Turbo Transfer – Biorad
• 2 lecteurs de gel de protéines : 1 ChemiDoc Touch – Biorad et 1 Odyssey CL-x – LI-COR

Centrifugation
• 2 centrifugeuses réfrigérées : 1 5810R – Eppendorf et 1 Mega Star 3.0R – VWR
• 2 ultracentrifugeuses sur pied : 2 Optima XPN-80 – Beckman
• 1 ultracentrifugeuse sur paillasse : Optima MAX-XP – Beckman
• 1 centrifugeuse haute vitesse : Avanti JE – Beckman
• 10 rotors

Interactions moléculaires
• 2 lecteurs de plaques : 1 Mithras LB940 – Berthold et 1 EnVision – Perkin Elmer
• 1 cuve de Langmuir-Blodgett : Microtrough XL – Kibron
• 1 diffusion dynamique de lumière multi-angle : Zetasizer Ultra – Malvern
• 1 dichroïsme circulaire : J-1500 – JASCO

Services proposés

La plateforme B&B propose des prestations de biologie moléculaire (clonage, mutagénèse dirigée, production d’ARNm), de biochimie (purification et fonctionnalisation de protéines natives ou recombinantes, solubles ou membranaires), et de biophysique (analyse de la taille et de la structure secondaire des protéines et des acides nucléiques, mesures d’interactions protéine-protéine et protéine-lipide). Ces prestations sont ouvertes à toutes les équipes de recherche publique, qu’elles fassent partie ou non de l’IPNP, ainsi qu’aux entreprises privées. B&B accompagne également les équipes scientifiques dans la conception et le suivi de leurs projets de recherche, et organise des formations ouvertes aux participants extérieurs à l’IPNP.

Thématiques

Analyses moléculaires, Biochimie, Biologie structurale, Génomique, Transcriptomique & Protéomique, Propriétés chimiques & physiques, Synthèse & Fabrication

Contact

Plateforme de Biochimie et Biophysique (B&B) de l’Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris (IPNP)
102-108 rue de la santé
75014 Paris
plateformebandb@gmail.com
Site web plateforme biochimie et biophysique

Tutelles

Université Paris Cité, Inserm

Unité de rattachement

Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris – UMR-S 1266

Réseaux

IVETh : plateforme d’expertise technologique de production, d’ingénierie, et de caractérisation de vésicules extracellulaires pour des thérapies personnalisées (SESAME Filières PIA 3)

Plateformes dans la même thématique

Plateforme « InterATOME »

La plateforme InterATOME est intégrée à l’équipe de recherche OGE – Expression génomique des organites au sein du Département Interactions Plantes Microorganismes et Réseaux de l’Institut des Sciences des Plantes – Paris-Saclay (IPS2) sur le plateau de Saclay.

La plateforme est dédiée au criblage à haut-débit des interactions protéine-protéine par un système de Double-Hybride sur levures (Y2H). Elle offre ses services dans le cadre de collaborations nationales et internationales. Lire la suite Plateforme « InterATOME »

Cordeliers Genotyping & Biochemistry (CGB) du CRC

Le CGB (Centre de Génotypage et de Biochimie) du Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) assure une prestation de service en génotypage et la mise à disposition d’appareils et matériel de biologie moléculaire et de biochimie. Ses infrastructures, ses équipements et le support scientifique et technique de son personnel sont à la disposition de tous les membres du CRC, de ses Universités de tutelle (Université Paris Cité et Sorbonne Université) ainsi qu’aux autres utilisateurs académiques ou privés. Les activités de génotypage du CGB sont engagées dans une démarche qualité depuis 2013 et sont certifiées iso 9001:v2015 et NFX-50-900. Le CGB est sous la responsabilité d’un responsable technique et opérationnel, Hermine Kakanakou. Lire la suite Cordeliers Genotyping & Biochemistry (CGB) du CRC

IPS2 Epigenomic Platform (IPSEP)

In the recent years, the term « epigenetic » is rather used to define all the processes regulating gene expression and genome architecture, in addition to the information carried by the DNA sequence, that can be more transient or facultative in nature. Epigenetics information relies on DNA and protein modifications such as cytosine methylation (5mC, 5hmC) and histone post-translational modifications (e.g. acetylation, methylation). Many studies have highlighted the determining role of epigenetic regulations, not only in adaptation to stress and changing environments but also in the control of development. A better understanding of such processes provides the tools necessary to the development of innovative and efficient approaches to crop improvement. In this context IPSEP offers the solutions to any epigenomic and bioinformatic analysis you are seeking. Lire la suite IPS2 Epigenomic Platform (IPSEP)

Service de spectrométrie de Masse du LCBPT

Le service de spectrométrie de masse du Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques est une plateforme implantée au sein du Campus Saint Germain dont l’usage principal est la caractérisation et quantification de petites molécules organiques et/ou de petites biomolécules (nucléotides, peptides). Cette plateforme est dotée de trois spectromètres de masse couplés à de la chromatographie liquide et un spectromètre couplé à de la chromatographie en phase gazeuse. L’ensemble de ces matériels est géré par un assistant ingénieur, Patrice Gerardo, qui effectue un peu plus de 10 000 analyses de routine par an. Il assure également la mise au point et le développement de techniques et méthodes analytiques nouvelles. Lire la suite Service de spectrométrie de Masse du LCBPT