Plateforme IMAG’IC
Présentation
La plateforme d’imagerie cellulaire IMAG’IC située en plein cœur de Paris est labellisée Gis Ibisa, France-BioImaging, EuroBioimaging et certifiée ISO 9001. Elle compte aujourd’hui 15 systèmes d’acquisition (plein champ, confocaux, super résolution (PALM, sptPALM, STORM 3D, STED 3D), multi-photon spectral SHG THG, TIRF, FLIM, FRET-FLIM, imagerie en flux, histo-cytométrie…) et 3 stations d’analyse et de traitement d’images, répartis sur 155 m² dont un tiers en Laboratoire de confinement L2 et L3. Toute personne dépendant d’un laboratoire public (EPST, université) ou privé peut bénéficier d’une assistance ou d’une formation pour devenir autonome, sur tous les microscopes gérés par la plateforme.
En parallèle, des prestations, de restauration d’image par déconvolution 3D, database, impression 3D, de coupe épaisse de
tissus par vibratome et de clarification de tissus sont proposées.
Activités
Expertises
Mise à disposition de l’ensemble des systèmes d’acquisition après formation :
- Clarification de tissus et d’organes ;
- Imagerie intra-vitale (anesthésie, chirurgie, contraste SHG et THG) sur modèles murins, poissons, ovo ;
- Microscopie de super-résolution : PALM, STORM, STED et ExM ;
- Imagerie en environnement confiné de niveau 2 et 3 pour l’étude d’interactions hôte-pathogène, de cellules et tissus humains ou
murins infectés ; - Analyse, traitement et quantification d’images, création de macros ImageJ (Imaris, Huygens et Matlab) ;
- Sauvegarde et archivage d’images, archivage collaboratif, annotation et visualisation d’images pyramidales, restauration d’images par déconvolution 3D en ligne (Cochin Image Database).
Equipements
Imagerie en Flux :
• ImageStreamX MKII 500A Roussy
Microscopie Super Résolution :
• Leica SP8X STED FLIM L2 510 Roussy
• Leica GSD 515 Roussy
Microscopes confocaux
• Spinning disk L3 300 Méchain
• Spinning disk L2 510 Roussy
• Leica SP8 Multi-Photon DIVE FLIM L2 632 Roussy
• Spinning disk L1 515 Roussy
• Spinning disk IXplore L1 522 Roussy
• Leica SP5 Multi-Photon 522 Roussy
Microscopes plein champ
• iMIC 522 Roussy
• Leica 500A Roussy
• Zeiss 515 Roussy
• Zeiss 3010 Fac
• Olympus 5012A Fac
Macroscopie
• Nikon Macroscope 5012A Fac
• Nikon loupe 5012A Fac
Imprimante 3D
• Polyjet Objet30Prime Stratasys
Vibratome
Stations d’analyse
Services proposés
- Clarification de tissu ;
- Microscopie super-résolution Pointillisme SMLM : STORM, PALM, sptPALM, 3DSTORM ;
- Microscopie d’Expansion ExM ;
- Coupe épaisse de tissu ( ~ 400µm) frais, fixé ;
- Imagerie intravitale ;
- Biomarqueurs : Ca²+, pH, NaDH, Red/Ox, tension membranaire ;
- FLIM Phasor FLIM-FRET ;
- Contraste SHG et THG (collagène I et III, os, fibrogenèse, sarcomères) ;
- Confinement L2 (tissu d’origine humaine) et L3 (interaction hôte-pathogène, bactéries, parasites, virus) ;
- Traitement d’images (Segmentation, Deep learning, Histo-cytométrie, Tracking).
Thématiques
Tutelles
Université Paris Cité, CNRS, Inserm
Unité de rattachement
UMR 8104 – Institut Cochin
Réseaux
France Bio-imaging
Labellisation
IBISA, ISO 9001
Plateformes dans la même thématique
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