Plateau technique – Génomique IJM
Présentation
Le plateau technique “Génomique & transcriptomique” rassemble des équipements dédiés à l’analyse des acides nucléiques et au séquençage de nouvelle génération. Ces équipements sont accessibles en libre service après formation d’un membre des équipes utilisatrices qui assurera ensuite la pérennité du savoir-faire au sein de son équipe accueillie.
Les équipements disponibles permettent la quantification et l’analyse des acides nucléiques, soit de manière globale (microspectrophotomètres, 2 machines, électrophorèse sur puces), soit de manière séquence spécifique, soit par PCR quantitative (4 machines 96 et 384 puits), soit par séquençage de nouvelle génération (un séquenceur Illumina MiSeq). Un Robot Pipetteur, un Robot préparateur d’échantillons, un lecteur de plaques 96 et un luminomètre plaque 96 sont aussi disponibles.
Activités
Expertises
- PCR quantitative en temps réel ;
- Séquençage de nouvelle génération ;
- Robotique ;
- Bioinformatique.
Equipements
Les équipements disponibles permettent la quantification et l’analyse des acides nucléiques :
- soit de manière globale (microspectrophotomètres, 2 machines, électrophorèse sur puces), soit de manière séquence spécifique,
- soit par PCR quantitative (4 machines 96 et 384 puits),
- soit par séquençage de nouvelle génération (un séquenceur Illumina MiSeq).
Un Robot Pipetteur, un Robot préparateur d’échantillons, un lecteur de plaques 96 et un luminomètre plaque 96 sont aussi disponibles.
Services proposés
Les équipements cités sont en libre service.
Plateformes dans la même thématique
Plateforme Histologie, Immunomarquage, Microdissection laser (Hist’IM) de l’Institut Cochin
La plateforme HistIM est ouverte aux équipes de l’institut Cochin mais aussi aux équipes extérieures, institutionnelles ou privées.
Elle propose des prestations techniques d’anatomie et pathologie, animale et humaine.
Plateforme Proteomique Structurale et Fonctionnelle (ProtéoSeine@IJM)
ProteoSeine@IJM est la plateforme protéomique de l’Institut Jacques Monod, UMR 7592 Université de Paris Cité – CNRS.
Les activités de la plateforme incluent du service analytique, de la recherche et du développement technique et méthodologique ainsi qu’une veille technologique active.
Plateforme Génomique de l’Institut Imagine – SFR Necker
La plateforme génomique d’Imagine a pour mission d’offrir des prestations de haut niveau dans le domaine du séquençage à haut débit (NGS) depuis 2010 et de l’expression génique à la communauté scientifique d’Imagine et du site Necker-Enfants Malades principalement mais pas exclusivement
Plateforme « InterATOME »
La plateforme InterATOME est intégrée à l’équipe de recherche OGE – Expression génomique des organites au sein du Département Interactions Plantes Microorganismes et Réseaux de l’Institut des Sciences des Plantes – Paris-Saclay (IPS2) sur le plateau de Saclay.
La plateforme est dédiée au criblage à haut-débit des interactions protéine-protéine par un système de Double-Hybride sur levures (Y2H). Elle offre ses services dans le cadre de collaborations nationales et internationales.
Centre de Génotypage et Biochimie (CGB) du CRC
Le CGB (Centre de Génotypage et de Biochimie) du Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) assure une prestation de service en génotypage et la mise à disposition d’appareils et matériel de biologie moléculaire et de biochimie. Ses infrastructures, ses équipements et le support scientifique et technique de son personnel sont à la disposition de tous les membres du CRC, de ses Universités de tutelle (Université Paris Cité et Sorbonne Université) ainsi qu’aux autres utilisateurs académiques ou privés. Les activités de génotypage du CGB sont engagées dans une démarche qualité depuis 2013 et sont certifiées iso 9001:v2015 et NFX-50-900. Le CGB est sous la responsabilité d’un responsable technique et opérationnel, Hermine Kakanakou.
IPS2 Epigenomic Platform (IPSEP)
In the recent years, the term « epigenetic » is rather used to define all the processes regulating gene expression and genome architecture, in addition to the information carried by the DNA sequence, that can be more transient or facultative in nature. Epigenetics information relies on DNA and protein modifications such as cytosine methylation (5mC, 5hmC) and histone post-translational modifications (e.g. acetylation, methylation). Many studies have highlighted the determining role of epigenetic regulations, not only in adaptation to stress and changing environments but also in the control of development. A better understanding of such processes provides the tools necessary to the development of innovative and efficient approaches to crop improvement. In this context IPSEP offers the solutions to any epigenomic and bioinformatic analysis you are seeking.