NeurImag de l’IPNP

Présentation

Bienvenue sur la plate-forme d’imagerie de l’Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris, localisée dans le 14ième arrondissement de Paris près du parc Montsouris. La plateforme évolue en collaboration directe avec l’INSERM, l’Université Paris Cité et l’Hôpital Sainte-Anne. La plateforme NeurImag est labélisée IBISA et membre de l’Infrastructure France Bio Imaging. Elle fait également partie du consortium UP3 des plateformes photoniques de l’université de Paris Cité.
La plateforme NeurImag propose trois types d’activités :

• Le service d’imagerie photonique qui a pour but d’aider et de proposer des solutions aux scientifiques internes et externes dans le domaine de la microscopie de fluorescence.
• Le service de culture primaire permettant ainsi aux utilisateurs d’avoir les échantillons biologiques (neurones, lignées cellulaires, astrocytes, microglie, organoïdes, ….) sur place.
• Le service d’analyse d’image qui a pour but de proposer des solutions quantitatives et automatiques pour l’analyse d’image.

Les utilisateurs de NeurImag, (internes, externes, académiques ou privés) une fois autorisés et formés par notre équipe, pourront avoir accès aux différents systèmes.
L’accès à la plate-forme implique l’acceptation des règles et procédures définies par la plate-forme et validées par le comité de direction de l’IPNP.

Lydia Danglot (Ph.D., Responsable Scientifique), David Geny (AI, Responsable Technique), Philippe Bun (Ph.D., IR) et Julie Nguyen

Activités

Expertises

Lydia Danglot (Ph.D., Directrice Scientifique), David Geny (IE, Responsable Technique), Philippe Bun (IR) et Julie Nguyen (IE, Responsable culture) assurent le bon fonctionnement de la plateforme NeurImag.

La plateforme de culture primaire offre des prestations allant de la culture de neurones primaires aux transfections et tests de sondes fluorescentes.
Des prestations d’immunomarquages sont également proposés et réalisées dans l’Institut pour être ensuite visualisés sur les systèmes de NeurImag.
Un contrôle de qualité est réalisé trimestriellement par le service afin de garantir le protocole de culture.
La plateforme d’imagerie propose des systèmes de microscopie couvrant une large gamme de techniques de microscopie, allant de la vidéo-microscopie à l’imagerie à super-résolution (PALM, STORM, STED 3D et SIM) en passant par l’imagerie dynamique (FCS, FLIM, FRAP, Photocativation ou conversion).
En plus des techniques de microscopie, la plateforme d’imagerie NeurImag peut vous apporter des solutions quant aux traitements et à l’analyse de vos images. Deux stations de travail sont disponibles si vous souhaitez utiliser les logiciels suivants : Icy, ImageJ, Imaris, FIJI, Volocity, Neurolucida, et Zen Blue.
La plateforme forme aussi les utilisateurs sur les systèmes afin qu’ils puissent mener leurs études en toute autonomie en bénéficiant de l’expérience des ingénieurs.
Nous vous invitons à nous contacter en cliquant sur le lien suivant : NeurImag.ipnp@inserm.fr

Equipements

Les systèmes suivant sont disponibles à l’utilisation :

•  Microscope à fluorescence basics (Zeiss Axioplan 2 et Nikon)
• Leica DMI8 équipé d’un Spinning disk Yokogawa X1, Gemini2C et double camera Flash4 pour l’imagerie rapide double couleurs.
• Zeiss scanneur de lames (avec AI)
• Microscope confocal Leica TCS SP5
• Microscope Confocal Leica TCS SP8, équipé d’un STED 3DX et des options FLIM et FCS.
• Microscope Zeiss LSM 880 équipé également des fonctionalités Airyscan, du SIM, du STORM.
• Microscope STORM 3D BRUKER Vutara équipé corrélativement d’un sweptfield, d’une camera grand champ, d’une camera intensifiée et d’une camerie haute vitesse.
• Microscopes a venir en 2023 : un lighsheet et un microscope 2photons.

Les détails techniques de ces systèmes sont mise a jour régulièrement sur le site internet de NeurImag
NeurImag met à disposition 6 laboratoires de confinement 2, dont une salle de travail dédiée spécifiquement à l’activité de prestations du service de culture cellulaire primaire et organoïdes.

Les laboratoires de confinement 2 sont équipés de :

• PSM de type II MSC Advantage 1.2 (2016) certifié NF
• Centrifugeuse réfrigéré SL16R (2016) munis de gobelets pour tubes 15mL et 50mL avec couvercles
• Incubateurs Thermo Scientific HERAcell® 150i
• Microscope Leica DMIL équipé corrélativement de fluorescence.

Services proposés

Les services de la plateforme NeurImag sont multiples et parmi d’autres vous trouverez:
– Imagerie par Section optique :
Microscopie Wide-field (pas de section) et Confocal à balayage
Microscopie Spinning-disc et Swept-field
Microscopie Total Internal Reflection (TIRF)

– Suivi d’intéractions et de dynamique moléculaire et subcellulaire :
Fluorescence Recovery After Photobleaching (FRAP)
Forster Resonance Energy Transfer (FRET)
Fluorescence Lifetime Imaging (FLIM)
Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS)

– Suivi à haute resolution spatiale et/ou temporelle :
Microscopie spinning-disk dual-view simultanée
Microscopie confocale Airyscan (et Fast Airyscan)
Microscopie à Illumination Structurée 3D (SIM)
Microscopie à épuisement d’émission stimulée 3D (STED)
Microscopie de Localisation de Molécules (PALM :PhotoActivated Localization microscop, 3D dSTORM : direct Stochastic Optical Reconstruction Microscopy)

– Photo-manipulation :Photo-ablation, Photo-activation, Photo-décageage

– Analyse d’image : Logiciels libres et commerciaux complémentés par l’écriture de macros/plugins à façon.

Les prestations en culture cellulaire disponibles sont les suivantes :

• Neurones (cortex ou hippocampe) & cellules gliales
• Préparation d’organoïdes ou de cellules en matrigel 3D
• Preparation de Lamelles (coating PDL , polyornithine, ou plasma cleaner) avec cellules
• Preparation de Lamelles seules
• Transfections, infections
• Immuno-marquages