Plateforme “ImagoSeine”

Présentation

“ImagoSeine” est la plateforme de service et de R&D (Recherches & Développement) en imagerie de l’Institut Jacques Monod.

Elle est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique nationale et internationale, publique et privée.

Elle propose et développe des prestations de haut niveau permettant la visualisation et l’analyse de la structure, de la dynamique, des interactions et des fonctions des échantillons biologiques.
Pour ce faire, ImagoSeine réunit en un même lieu des ressources en cytométrie en flux, microscopie électronique et microscopie photonique.

Activités

Expertises

La cytométrie en flux permet l’analyse quantitative multiparamétrique (propriétés morphologiques, fluorescence) à l’échelle de la cellule (ou particule) unique (Immunophénotypage, cycle cellulaire, viabilité, expression de gène, fonction cellulaire). Cette technologie permet également l’isolation de population spécifique pour diverses applications (clonage, imagerie cellulaire, séquençage de cellule unique).

La microscopie électronique permet l’analyse ultrastructurale de la cellule et de ses composants. Elle comprend la microscopie à transmission, la microscopie électronique à balayage, la microscopie électronique 3D (tomographie électronique et Serial-Block-Face) et la préparation des échantillons à température ambiante ou à basse température.

La microscopie photonique permet la visualisation et l’analyse de la structure et de processus dynamiques au niveau cellulaire (procaryotes et eucaryotes) et tissulaire. Elle propose des expertises et des équipements innovants, permettant des observations de la molécule unique jusqu’à l’échelle d’un organisme.

Equipements

Microscopie électronique:
– 1 microscope électronique en trasnmission Tecnai 12 équipé d’une caméra CCD (OneView 4Kx4K Gatan) piloté par le logiciel GMS
– 1 microscope électronique à balayage TeneoVS, équipé de détecteurs ETD, SE et BSE et du module VolumeScope (pour le mode Serial-Block-Face) piloté par les logiciels FEI et Maps2
– Porte objet Tomographie Fischione 2020, avec inclinaison jusqu’à +/-80°
– 1 appareil de cryofixation  à  haute pression Leica EM PACT2.
– 1 automate de cryosubstitution AFS2 Leica.
– 2  ultramicrotomes (1 UC6 Leica, 1 UCT Leica) : réalisation de coupes semi-fines et ultrafines d’échantillons biologiques inclus dans différentes résines
– 1 ultracryomicrotome (UC7-FC7 Leica): réalisation de coupes semi-fines et ultrafines d’échantillons biologiques congelés.
– 1 évaporateur de carbone Cressington 308R : évaporation sous vide de carbone sur des grilles

Microscopie photonique:
– 1 microscope Plein champ
– 1 stéréo microscope
– 3 Spinning disk dont l’un équipé pour les expériences de FRAP et la photo-ablation UV
– 3 Confocaux à balayage laser dont deux équipé du module Airyscan2 pour plus de sensibilité, de vitesse et résolution
– l’un équipé pour la microscopie 2 photon et un autre d’un module FLIM, FCS, PIE
– 1 microscope en super résolution SIM, PALM/STORM

Cytométrie en Flux:
– 1 Cytomètre en flux Analyseur et Trieur sous hotte (classe 2) ( (FACS Aria Fusion, BD Biosciences)
– 1 Cytomètre en flux Analyseur (Accuri C6+, BD Biosciences)
– Logiciel FlowJo (BD Biosciences)

Services proposés

Nous sommes une équipe d’ingénieurs, provenant de disciplines différentes (biologie, physique, informatique), travaillant sur l’interface de la microscopie avec la biologie. Nous proposons :
– l’orientation des utilisateurs vers l’équipement le plus adapté à leur projet ;
– l’aide à la conception des outils : biologie moléculaire, étiquetage des protéines, choix des marquages et des fluorophores, protocoles d’analyse, etc.
– l’aide à la mise en place de l’expérience : définition des contrôles, des modes opératoires, des précautions à prendre vis-à-vis des artefacts potentiels ;
– l’encadrement éventuel des utilisateurs pour la réalisation des expériences;
– la mise à disposition d’équipements fonctionnels et calibrés ;
– la formation des utilisateurs pour une utilisation autonome des équipements ;
– la prise en charge de projets, du traitement des échantillons aux acquisitions pour les utilisateurs non autonomes ;
– l’aide au traitement et à l’analyse des données obtenues ;
– l’aide à l’interprétation et présentation des résultats.