Plateforme IMAG’IC

Présentation

La plateforme d’imagerie cellulaire IMAG’IC située en plein cœur de Paris est labellisée Gis Ibisa, France-BioImaging, EuroBioimaging et certifiée ISO 9001. Elle compte aujourd’hui 15 systèmes d’acquisition (plein champ, confocaux, super résolution (PALM, sptPALM, STORM 3D, STED 3D), multi-photon spectral SHG THG, TIRF, FLIM, FRET-FLIM, imagerie en flux, histo-cytométrie…) et 3 stations d’analyse et de traitement d’images, répartis sur 155 m² dont un tiers en Laboratoire de confinement L2 et L3. Toute personne dépendant d’un laboratoire public (EPST, université) ou privé peut bénéficier d’une assistance ou d’une formation pour devenir autonome, sur tous les microscopes gérés par la plateforme.

En parallèle, des prestations, de restauration d’image par déconvolution 3D, database, impression 3D, de coupe épaisse de
tissus par vibratome et de clarification de tissus sont proposées.

Activités

Expertises

Mise à disposition de l’ensemble des systèmes d’acquisition après formation :

  • Clarification de tissus et d’organes ;
  • Imagerie intra-vitale (anesthésie, chirurgie, contraste SHG et THG) sur modèles murins, poissons, ovo ;
  • Microscopie de super-résolution : PALM, STORM, STED et ExM ;
  • Imagerie en environnement confiné de niveau 2 et 3 pour l’étude d’interactions hôte-pathogène, de cellules et tissus humains ou
    murins infectés ;
  • Analyse, traitement et quantification d’images, création de macros ImageJ (Imaris, Huygens et Matlab) ;
  • Sauvegarde et archivage d’images, archivage collaboratif, annotation et visualisation d’images pyramidales, restauration d’images par déconvolution 3D en ligne (Cochin Image Database).

Equipements

Imagerie en Flux :
• ImageStreamX MKII 500A Roussy

Microscopie Super Résolution :
• Leica SP8X STED FLIM L2 510 Roussy
• Leica GSD 515 Roussy

Microscopes confocaux
• Spinning disk L3 300 Méchain
• Spinning disk L2 510 Roussy
• Leica SP8 Multi-Photon DIVE FLIM L2 632 Roussy
• Spinning disk L1 515 Roussy
• Spinning disk IXplore L1 522 Roussy
• Leica SP5 Multi-Photon 522 Roussy

Microscopes plein champ
• iMIC 522 Roussy
• Leica 500A Roussy
• Zeiss 515 Roussy
• Zeiss 3010 Fac
• Olympus 5012A Fac

Macroscopie
• Nikon Macroscope 5012A Fac
• Nikon loupe 5012A Fac

Imprimante 3D
• Polyjet Objet30Prime Stratasys

Vibratome

Stations d’analyse

Services proposés

  • Clarification de tissu ;
  • Microscopie super-résolution Pointillisme SMLM : STORM, PALM, sptPALM, 3DSTORM ;
  • Microscopie d’Expansion ExM ;
  • Coupe épaisse de tissu ( ~ 400µm) frais, fixé ;
  • Imagerie intravitale ;
  • Biomarqueurs : Ca²+, pH, NaDH, Red/Ox, tension membranaire ;
  • FLIM Phasor FLIM-FRET ;
  • Contraste SHG et THG (collagène I et III, os, fibrogenèse, sarcomères) ;
  • Confinement L2 (tissu d’origine humaine) et L3 (interaction hôte-pathogène, bactéries, parasites, virus) ;
  • Traitement d’images (Segmentation, Deep learning, Histo-cytométrie, Tracking).

Thématiques

Analyses moléculaires, Imagerie

Contact

22 rue Méchain
75014 Paris

email
Site web

Tutelles

Université Paris Cité, CNRS, Inserm

Unité de rattachement

UMR 8104 – Institut Cochin

Réseaux

France Bio-imaging

Labellisation

IBISA, ISO 9001
 

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