Plateforme de Modélisation des Molécules, Matériaux et Biomolécules – P3MB

Présentation

Cette plateforme basée sur le calcul haute performance (HPC) fournit des ressources matérielles et logicielles adaptées à la modélisation de systèmes de différentes natures : moléculaire, biomoléculaire et matériaux. Une expertise dans l’utilisation des équipements et un environnement de travail simple, efficace et performant sont proposés.

La plateforme P3MB est localisée au 4ème étage du bâtiment Lavoisier.

Activités

Expertises

Classiquement, les problématiques que la plateforme P3MB peut prendre en charge sont les suivants

• Détermination des propriétés conformationnelles de molécules et biomolécules au niveau classique et/ou quantique ;
• Spectroscopie théorique et moléculaire (IR, Raman, UV et RMN) ;
• Détermination de la réactivité chimique par les méthodes de la chimie quantique (Calculs ab initio et DFT) : chemins de réactions, états de transition, complexes ;
• Photochimie théorique : étude des états excités des molécules (Calculs TD-DFT) ;
• Applications aux sciences des matériaux : modélisation des surfaces, adsorption moléculaires ou biomoléculaires sur surfaces (Calculs VASP et AMBER) ;
• Visualisation molécule et biomoléculaire avancée à l’aide de la réalité virtuelle.

Équipements

• Ordinateur de traitement sous windows et linux ;
• Ensemble de logiciels pour le calcul, l’analyse et la visualisation des résultats ;
• Cluster de calcul haute performance ;
• Un espace de stockage de 5 To ;
• Casques de réalité virtuelle de type oculus rift.

Services proposés

• Formation de base à l’utilisation de l’équipement informatique et des logiciels de modélisation ;
• Transfert de connaissances et compétences en informatique scientifiques ;
• Prise en charge complète d’une étude dans le cadre d’une prestation et convention ;
• Guider le choix des méthodes et des outils pertinents au problème et à l’architecture des machines informatiques ciblées.