Plateau – Macromolecular Modeling Platform

Présentation

Créé en 2012, le plateau de modélisation macromoléculaire du LCBPT exploite des approches in silico pour répondre à des questions structurales ou fonctionnelles sur des molécules ou complexes d’intérêt biologique. Elle est ouverte à la communauté scientifique académique dans un cadre collaboratif. Le plateau est localisé au 1er étage du Campus Saint-Germain-des-Prés de l’Université de Paris-Cité, porte R150.

Activités

Expertises

– Génération de modèles 3D de protéine.
– Études prédictives de l’impact de mutations sur la stabilité d’une protéine, l’affinité d’une molécule dans un complexe (petite molécule/protéine, protéine/protéine).
– Prédiction de l’interaction entre 2 systèmes moléculaires par docking (petite  molécule/protéine, protéine/protéine).
– Identification de petites molécules d’intérêt biologique par criblage virtuel de la chimiothèque du LCBPT.

Equipements

• 1 station de travail Dell Precision 7920, 2x Intel ® Xeon ® Gold 6248R CPU@3.0-4.0 GHz Turbo, 48 cœurs, 96 processeurs (2022)
• 1 station de travail Dell Precision 7810, 2x Intel ® Xeon ® CPU E5 2640 v3 @2.60-3.40 GHz, 16 cœurs, 32 processeurs (2016).

Services proposés

Le plateau propose un accompagnement complet (conseils, mise en œuvre des expériences, analyse des résultats).

Thématiques

Bioinformatique, Données & métadonnées, Simulation expérimentale & numérique

Contact

45 rue des saints-Pères
75006 Paris

email
Site web

Tutelles

Université Paris Cité, CNRS

Unité de rattachement

Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques – UMR 8601

Réseaux

iPOP-UP (Integrative Platform for Omics Projects de l’Université Paris Cité)
 

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