Plateau – Macromolecular Modeling Platform

Présentation

Créé en 2012, le plateau de modélisation macromoléculaire du LCBPT exploite des approches in silico pour répondre à des questions structurales ou fonctionnelles sur des molécules ou complexes d’intérêt biologique. Elle est ouverte à la communauté scientifique académique dans un cadre collaboratif. Le plateau est localisé au 1er étage du Campus Saint-Germain-des-Prés de l’Université de Paris-Cité, porte R150.

Activités

Expertises

– Génération de modèles 3D de protéine.
– Études prédictives de l’impact de mutations sur la stabilité d’une protéine, l’affinité d’une molécule dans un complexe (petite molécule/protéine, protéine/protéine).
– Prédiction de l’interaction entre 2 systèmes moléculaires par docking (petite  molécule/protéine, protéine/protéine).
– Identification de petites molécules d’intérêt biologique par criblage virtuel de la chimiothèque du LCBPT.

Equipements

• 1 station de travail Dell Precision 7920, 2x Intel ® Xeon ® Gold 6248R CPU@3.0-4.0 GHz Turbo, 48 cœurs, 96 processeurs (2022)
• 1 station de travail Dell Precision 7810, 2x Intel ® Xeon ® CPU E5 2640 v3 @2.60-3.40 GHz, 16 cœurs, 32 processeurs (2016).

Services proposés

Le plateau propose un accompagnement complet (conseils, mise en œuvre des expériences, analyse des résultats).

Thématiques

Contact

45 rue des saints-Pères
75006 Paris

email
Site web

Tutelles

Université Paris Cité, CNRS

Unité de rattachement

Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques – UMR 8601

Réseaux

iPOP-UP (Integrative Platform for Omics Projects de l’Université Paris Cité)
 

Plateformes dans la même thématique

Plateforme de criblage par ARN interférence (PARi)

La plateforme PARi est dédiée au criblage à haut débit (High-Throughput Screening, HTS) et à haut contenu (High-Content Screening, HCS) de banques de perturbateurs biologiques (siRNAs, petites molécules…) sur tests cellulaires.

Plateforme RV-PSY de l’Institut de psychologie

Crée en 2018, la plateforme de réalité virtuelle mutualisée hébergé au sein de l’institut de psychologie est dédiée aux différents domaines d’application de la psychologie. La plateforme RV-PSY est dotée d’un atelier de création d’environnements virtuels et de salles immersives.

Plateforme Protéomique SFR Necker (PPN) de la SFR Necker

Fondée en 2006, la plateforme PPN fait partie de la SFR Necker et du réseau des plateformes protéomiques de l’Université Paris Cité. Au cœur d’un centre hospitalo-universitaire d’excellence, elle offre une technologie et une expertise de pointe pour mieux comprendre les maladies

Cohorte EDEN du CRESS

L’étude EDEN est la première Étude de cohorte généraliste menée en France sur les Déterminants pré- et postnatals précoces du développement psychomoteur et de la santé de l’ENfant.

L’objectif d’EDEN est de mieux comprendre l′importance des déterminants précoces sur la santé des individus, en particulier en regard des facteurs d’environnement qui l’influencent au cours de l’enfance, puis de la vie adulte. En effet, au cours des dernières décennies, il est devenu de plus en plus clair que des événements survenant avant la naissance ou durant les premiers mois de vie peuvent avoir des conséquences sur la santé à long terme, même s’ils n’affectent pas la santé immédiate. L’exemple le plus connu est l’augmentation du risque de développer des maladies cardiovasculaires à l’âge adulte chez les personnes nées avec un petit poids de naissance.

NeurImag de l’IPNP

Bienvenue sur la plate-forme d’imagerie de l’Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris, localisée dans le 14ième arrondissement de Paris près du parc Montsouris. La plateforme évolue en collaboration directe avec l’INSERM, l’Université Paris Cité et l’Hôpital Sainte-Anne. La plateforme NeurImag est labélisée IBISA et membre de l’Infrastructure France Bio Imaging. Elle fait également partie du consortium UP3 des plateformes photoniques de l’université de Paris Cité.

Centre des Humanités Numériques des Grands Moulins – Direction générale déléguée des bibliothèques et musées

Le Centre des humanités numériques (CHN) est une plateforme de la Faculté Sociétés & Humanités d’Université Paris Cité portée opérationnellement par la Direction des Bibliothèques et Musées (DGDBM). Il s’adresse aux doctorants et aux communautés de recherche de la Faculté Sociétés & Humanités d’Université Paris Cité, ainsi qu’aux acteurs des humanités numériques du site géographique parisien.