Genome Engineering in Epigenetics (GENIE)

Présentation

Le plateau technique « Genome ENgeneering In Epigenetics » ( GENIE ) est axée sur les diverses applications des technologies CRISPR/Cas dans le domaine de l’épigénétique. Notre objectif est d’accélérer vos recherches en facilitant le choix des outils d’édition du génome, épigénome et autres outils basés sur les technologies CRISPR/Cas. GENIE est ouvert à tout les membres de l’unité UMR7216 Épigénétique et destin cellulaire à et dans une certaine limite aux membres des projets transversaux du Labex « Who am I ? ». L’acceptation des projets externes est possible après discussion avec le comité de pilotage et en fonction des ressources disponibles.

Activités

Expertises

Nous apporterons notre expertise dans les domaines suivants :

• L’édition du génome, comme le knock-out, le knock-in, et l’introduction de mutations ponctuelles : conception de stratégies, modifications des outils existants, et suggestions pour les stratégies de criblage ;
• La modulation de l’expression des gènes et la modification de l’épigénome ;
• L’utilisation des technologies CRISPR/Cas pour l’imagerie et l’identification de la composition protéique du locus à l’aide de techniques de marquage de proximité ;
• Le ciblage de l’ARN par CRISPR /Cas pour la dégradation, l’imagerie ou l’édition.

En collaboration avec d’autres plateaux techniques locaux, nous aidons à la conception sur mesure de stratégies expérimentales pour répondre aux besoins des utilisateurs·trices, à générer les outils nécessaires et à valider les modifications générées. GENIE aide à déterminer les séquences guides et à concevoir la stratégie d’ingénierie la mieux adaptée pour chaque projet, en mettant l’accent sur la facilité du criblage en aval. Nous aidons également à choisir la meilleure façon de délivrer les composants pour l’édition (epi)génétique dans les cellules.

Services proposés

Le plateau offre un accès à une banque commune d’outils moléculaires pour l’ingénierie des génomes, des épigénomes et modifications d’ARN.
Il fournit des protocoles, propose des conseils et soutien pour toutes les utilisations de l’ingénierie des génomes et épigénomes et autres applications basées sur les technologies CRISPR/Cas.
GENIE teste et met en œuvre de nouvelles approches d’ingénierie adaptées aux besoins des équipes de l’unité.
Si besoins, les utilisateurs·trices peuvent être formé·es aux applications basées sur la technologie CRISPR/Cas. Le plateau propose un cours sur l’édition du génome et épigenome et anime le groupe de discussion « CRISPR Aficionados ».