Exploration du Métabolisme énergétique de la cellule au petit animal : Métabol’IC de l’Institut Cochin

Présentation

L’homéostasie énergétique chez l’être vivant peut se définir au travers du principe de conservation de la matière : « Rien ne se perd, rien ne se crée », tout se transforme (Lavoisier, Traité élémentaire de chimie, 1789).
La vocation de la plateforme Métabol’IC est d’offrir aux scientifiques une caractérisation exhaustive des composantes de l’homéostasie énergétique de la cellule au petit animal.

Localisée à l’Institut Cochin (Inserm U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Cité), la plateforme Métabol’IC est ouverte à la communauté académique et industrielle

Elle est placée sous la responsabilité de Raphaël DENIS (contact: u1016-metabolic@inserm.fr)

Activités

Expertises

Une expertise et un soutien dans l’élaboration des protocoles d’explorations physiologiques chez l’animal et dans la cellule.

• Élaboration des protocoles d’explorations physiologiques.
• Physiologie animale et de l’exploration métabolique fonctionnelle chez l’animal in vivo.
• Mesurer en temps réel le métabolisme énergétique cellulaire sur des cellules vivant.

Nos outils s’inscrivent dans la compréhension de la physiopathologie des maladies métaboliques (diabète, syndrome métabolique, troubles du comportement alimentaire, cancer, etc.). Cela comprend la régulation physiologique de processus métaboliques d’une part et, d’autre part, des processus de dérèglement du métabolisme énergétique et du comportement alimentaire dans des conditions physiopathologiques tel que l’obésité et le diabète

Fort de l’expérience de chercheurs reconnues dans le métabolisme cellulaire, la plateforme propose une aide à la réalisation de protocole d’exploration sur un Seahorse XF Pro et son système d’imagerie Cytation 1.

La plateforme est intégrée au sein de l’axe des plateformes de l’Institut Cochin, qui offre une large gamme d’expertises : création de lignées murines, caractérisation et marquage cellulaire, imagerie à différentes résolutions, analyses protéomiques et génomique.

En savoir plus

Équipements

Outils de la plateforme :

1. Un système de calorimétrie indirecte (Promethion) enregistrant en simultané et en temps réel:
   • la prise alimentaire et hydrique
   • la consommation de O2 et la production de CO2
   • Le quotient respiratoire (indicateur de l’oxydation des substrats)
   • La dépense énergétique totale et au repos
   • l’activité locomotrice spontanée
   avec possibilité de modifier les paramètres environnementaux (température, les cycles jour/nuit)
2. Un système d’appareils RMN permettant l’analyse non invasive et rapide de la teneur totale en matière grasse et maigre, et en fluide biologique chez le rongeur (LF90II-Bruker).
3. Un analyseur Seahorse XF Pro (96 puits) couplé à un système d’imagerie «Cell Imager Cytation 1» offrant la possibilité de normaliser les résultats. Ce système mesure en temps réel le métabolisme énergétique des cellules vivantes ex vivo (confinement L2 avec accès à un PSM, un incubateur cellulaire et une salle d’expérimentation) incluant :
   • les taux consommation d’oxygène et d’acidification extracellulaire
   • la production d’ATP dans la mitochondrie et issus de la glycolyse.
   • Les composants oxydatif et glycolytique de la bioénergétique cellulaire peuvent être déterminés en réponse aux inhibiteurs des voies métaboliques.
4. Une zone d’hébergement pour 80 souris (Innovive & Techniplast).
5. Sécurisation et sauvegarde des données sur “Cochin Image Database”.

Services proposés

La plateforme propose des prestations complètes d’exploration du métabolisme énergétique, allant de la conception et de la mise en œuvre d’un protocole expérimental à l’analyse et l’interprétation des données, en tenant compte du modèle utilisé et de la question scientifique posée.

L’élaboration des protocoles expérimentaux est réalisée dans le respect des réglementations éthiques et sanitaires en vigueur. Nous accompagnons également les utilisateurs dans la préparation des dossiers de demande d’autorisation d’utilisation des animaux à des fins scientifiques.

La plateforme propose par ailleurs l’hébergement de souris dans le cadre d’études longitudinales, avec suivi alimentaire, suivi du poids corporel et mesure de la composition corporelle par résonance magnétique nucléaire (RMN).

Les appareils de RMN (LF90II) ainsi que l’analyseur Seahorse XF Pro sont mis à la disposition des utilisateurs. Des formations spécifiques à l’utilisation de ces équipements et à l’analyse des données sont proposées aux nouveaux utilisateurs.

Nous réalisons également des prestations d’analyse et d’interprétation de données issues de la calorimétrie indirecte, collectées sur d’autres sites expérimentaux.

Enfin, la plateforme Métabol’IC développe et dispense des formations continues en analyses métaboliques à destination du personnel technique, des chercheurs et des étudiants de l’Université Paris Cité.