Cordeliers Histology, Imaging, Cytometry & Spatial-Omics (CHICS) du CRC

Présentation

La plateforme “Cordeliers histology, imaging, cytometry and spatial omics” (CHICS) du Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) offre des équipements et des services dans les domaines de l’histologie, de la biologie spatiale, de l’imagerie et de la cytométrie en flux. Ses infrastructures, ses équipements et le support scientifique et technique de son personnel sont à la disposition de tous les membres du CRC, de ses Universités de tutelle (Université Paris Cité et Sorbonne Université) ainsi qu’aux autres utilisateurs académiques ou privés.

Le CHICS s’engage également à former ses utilisateurs au travers de formations internes ou en intervenant dans des formations universitaires. Les activités de la plateforme sont engagées dans une démarche qualité depuis 2013 et sont certifiées ISO 9001 : v2015 et NFX 50-900. Le CHIC est supervisé par un responsable technique et opérationnel : Christophe Klein (christophe.klein@crc.jussieu.fr).

Activités

Expertises

CHICS assure les prestations de routine en histologie, imagerie cellulaire et cytométrie en flux, et a pour objectif depuis 2018 de renforcer ses capacités d’analyse en multiplex. CHICS s’est équipé d’un Leica BOND RX ainsi que d’un Akoya PhenoImager (ex-Vectra Polaris) pour le développement et la prestation d’immunomarquage multiplexés à haut débit. Il développe également un plateau de protéomique et transcriptomique spatiale comprenant un nanoString GeoMx Digital Spatial Profiler, accompagné d’un nCounter MAX ainsi qu’un 10X Genomics CytAssist. Il a, de plus, une activité de développement dans le domaine de l’intelligence artificielle appliquée à l’analyse des images de lames histologiques.

Equipements

Plateau d’Histologie et SpatialOmics :

• Automate d’inclusion en paraffine ASP300 et sa fontaine d’enrobage Histocore Arcadia, Leica Biosystems ;
• 2 Cryostats (CM3050S et CM1850UV), Leica Biosystems.
• 2 Microtomes (RM2145 et RM2155), Leica Biosystems.
• Automate de marquage BOND RX, Leica Biosystems.
• Automate de marquage AS48Link, Agilent DAKO.
• GeoMx Digital Spatial Profiler, nanoString.
• nCounter MAX (PrepStation & Digital Analyser), nanoString.
• CytAssist, 10X Genomics.

Plateau d’Imagerie :

• Microscope confocal LSM 710, Zeiss.
• Microscope à fluorescence Axio Observer.Z1, Zeiss.
• Microscope à fluorescence à détection spectrale Mantra, Akoya.
• Scanner de Lames Axio Scan.Z1, Zeiss.
• Scanner de Lames PhenoImager (ex-Vectra Polaris), Akoya.
• 3 stations d’analyse d’images équipées des logiciels Visiopharm® (modules Artificial Intelligence, Phenotyping) et Akoya InForm® pour l’analyse des lames scannées et des immunomarquages multipléxés.

Plateau de Cytométrie :

• Cytomètre analyseur LSR II, BD.
• Cytomètre analyseur Fortessa X20, BD.
• Cytomètre trieur FACS Aria III, BD.
• Cytomètre trieur Influx, BD.
• Immunoessai multi-analytes FlexMap3D, Luminex.

Services proposés

Les activités de la plateforme CHICS s’inscrivent dans un service d’accompagnement à la recherche de la communauté scientifique du CRC et extérieure. Les services proposés par la plateforme CHICS sont :

• La mise à disposition de matériels et infrastructures après formation à l’utilisation des appareils ;
• La prestation de service avec prise en charge de tout ou partie d’un projet de recherche.

Elles sont le fruit d’un travail de conseils et de mises au point expérimentales effectuées en collaboration avec l’utilisateur de la plateforme.
La réservation des équipements du CHIC se fait via OpenIRIS, accessible à l’adresse suivante : https://su.openiris.io/