Présentation
La Plate-Forme d’imagerie cellulaire IMAG’IC située en plein cœur de Paris est Labellisée Gis Ibisa, France-BioImaging, EuroBioimaging et certifiée ISO 9001. Elle compte aujourd’hui 15 systèmes d’acquisition (plein champ, confocaux, super-résolution (PALM, sptPALM, STORM 3D, STED 3D), multi-photon spectral SHG THG, TIRF, FLIM, FRET-FLIM, imagerie en flux, histo-cytométrie…) et 3 stations d’analyse et de traitement d’images, répartis sur 155 m² dont un tiers en Laboratoire de confinement L2 et L3. Toute personne dépendant d’un laboratoire public (EPST, université) ou privé peut bénéficier d’une assistance ou d’une formation pour devenir autonome, sur tous les microscopes gérés par la plate-forme.
En parallèle, des prestations, de restauration d’image par déconvolution 3D, database, impression 3D, de coupe épaisse de tissus par vibratome et de clarification de tissus sont proposées.
Activités
Expertises
Mise à disposition de l’ensemble des systèmes d’acquisition après formation,
Clarification de tissus et d’organes,
Imagerie intra-vitale (anesthésie, chirurgie, contraste SHG et THG) sur modèles murins, poissons, ovo,
Microscopie de super-résolution : PALM, STORM, STED et ExM,
Imagerie en environnement confiné de niveau 2 et 3 pour l’étude d’interactions hôte-pathogène, de cellules et tissus humains ou murins infectés,
Analyse, traitement et quantification d’images, création de macros ImageJ (Imaris, Huygens et Matlab),
Sauvegarde et archivage d’images, archivage collaboratif, annotation et visualisation d’images pyramidales, restauration d’images par déconvolution 3D en ligne (Cochin Image Database).
Equipements
Imagerie en Flux
ImageStreamX MKII 500A Roussy
Microscopie Super Résolution
Leica SP8X STED FLIM L2 510 Roussy
Leica GSD 515 Roussy
Microscopes confocaux
Spinning disk L3 300 Méchain
Spinning disk L2 510 Roussy
Leica SP8 Multi-Photon DIVE FLIM L2 632 Roussy
Spinning disk L1 515 Roussy
Spinning disk IXplore L1 522 Roussy
Leica SP5 Multi-Photon 522 Roussy
Microscopes plein champ
iMIC 522 Roussy
Leica 500A Roussy
Zeiss 515 Roussy
Zeiss 3010 Fac
Olympus 5012A Fac
Macroscopie
Nikon Macroscope 5012A Fac
Nikon loupe 5012A Fac
Imprimante 3D
Polyjet Objet30Prime Stratasys
Vibratome
Stations d’analyse
Services proposés
Clarification de tissu
Microscopie super-résolution Pointillisme SMLM : STORM, PALM, sptPALM, 3DSTORM
Microscopie d’Expansion ExM
Coupe épaisse de tissu ( ~ 400µm) frais, fixé
Imagerie intravitale
Biomarqueurs : Ca²+, pH, NaDH, Red/Ox, tension membranaire
FLIM Phasor FLIM-FRET
Contraste SHG et THG (collagène I et III, os, fibrogenèse, sarcomères)
Confinement L2 (tissu d’origine humaine) et L3 (interaction hôte-pathogène, bactéries, parasites, virus)
Traitement d’images (Segmentation, Deep learning, Histo-cytométrie, Tracking)
Thématiques
Analyses moléculaires et Imagerie
Contact
IMAG'IC
22 rue Méchain
bâtiment Roussy
Paris
75014
u1016-imagic@inserm.fr
https://institutcochin.fr/plateformes/imagic
Tutelles
INSERM, CNRS, Université Paris Cité
Réseaux
FBI
Labélisations
Oui